Na área de Assistência Social a APAE de Jaboticabal executa serviços socioassistenciais tipificados de Média e Alta Complexidade, de modo permanente, continuado, planejado e totalmente gratuito às Famílias e Pessoas com Deficiência.
Realiza Atendimentos, Defesa de Direitos e Assessoramento, promovendo segurança social aos usuários; acesso aos direitos; convívio familiar, comunitário e social; desenvolvimento da autonomia e qualidade de vida.

- Nível de Média Complexidade - Serviço de Proteção Social Especial para Pessoas com Deficiência, Idosas e suas Famílias.
Oferta atendimento especializado a até 100 pessoas com deficiências, com algum grau de dependência agravada por situações de risco pessoal ou social, na Modalidade de Centro-Dia.
Oferta atendimentos especializados a 80 famílias e/ou cuidadores atuando sobre as situações de vulnerabilidade e risco social, fortalecendo a função protetiva e promovendo o acesso à rede de serviços socioassistenciais e afins, e ao Sistema de Garantia de Direitos.

- Nível de Alta Complexidade – Serviço de Acolhimento Institucional para Jovens e Adultos com Deficiência, na Modalidade de Residência Inclusiva
Destinado a 10 pessoas com deficiência, de ambos os sexos, com vínculos familiares rompidos ou fragilizados e que não dispõem de condições de autossustentabilidade, nem de retaguarda familiar.
O Serviço Socioassistencial proporciona cuidado e atenção às necessidades individuais e coletivas deste público, que convive num espaço inserido na comunidade, representando um lar, assistido por cuidadores, ininterruptamente. E tem por finalidade desenvolver a autonomia, a inclusão social e comunitária dos residentes e a reinserção deles em família extensa.